矮大頭油葵種子圓錐形直根系，由主根、側根、須根和根毛組成。矮大頭油葵種子種子吸水萌發首先長出一條胚根，其尖端生長點不斷細胞分裂，逐漸生長，發育成圓錐型的主根，主根入土深1.5~2米，側根斜向伸展0.8~1米，大部分集中在表層0~40厘米耕作層中，占總根系的66%左右。
主根(gen)(gen)(gen)在地下20～30厘米(mi)深的一(yi)段(duan)較粗，主根(gen)(gen)(gen)上(shang)長有(you)很(hen)多側根(gen)(gen)(gen)，這些側根(gen)(gen)(gen)向(xiang)水平(ping)伸展，分(fen)(fen)布(bu)直徑80～100厘米(mi)。側根(gen)(gen)(gen)上(shang)有(you)須根(gen)(gen)(gen)，須根(gen)(gen)(gen)上(shang)長有(you)稠密(mi)的根(gen)(gen)(gen)毛與土(tu)壤緊密(mi)接觸(chu)吸收(shou)水分(fen)(fen)和(he)養分(fen)(fen)。其根(gen)(gen)(gen)系龐大，吸收(shou)能力強，因而抗旱、耐瘠(ji)性很(hen)強。